ABD’deki ve dünyadaki pamuk üreticileri, tekstil endüstrisi için yüksek kaliteli lifler üretirken kuraklığa, haşerelere ve patojenlere daha iyi dayanabilen yeni çeşitler arıyor.
Pamuk çeşitlerinin ıslahını ve ıslahını hızlandırmaya yardımcı olmak, Ulusal Bilim Vakfı-de finanse edilen araştırmacılar Austin’deki Teksas ÜniversitesiHudsonAlpha Biyoteknoloji Enstitüsü, Texas A&M Üniversitesi ve başka yerler, ikisi ekili pamuk da dahil olmak üzere beş pamuk türünün referans dereceli genomlarını üretmek için bir araya geldi. Onların sonuçları yayınlandı Doğa Genetiği.
Yetiştirilen pamuklar tetraploiddir, yani her birinin dört set kromozomu vardır: ikisi Afrika’dan (Eski Dünya) bir ‘anneden’ ve ikisi Amerika’dan (Yeni Dünya) bir ‘babadan’. “Birleşme” yaklaşık bir buçuk milyon yıl önce Yeni Dünya’da gerçekleşti ve beş tür üretti.
Son 8.000 yılda, iki tür birbirinden bağımsız olarak dünya çapındaki pamuk üretiminin %95’ini ve %5’ini oluşturan Upland (veya Amerikan) ve Pima (veya Mısır) pamuklarına evcilleştirildi. Hawaii, Brezilya ve Galapagos Adaları’nda çeşitlenen üç vahşi akraba.
Ekip, yabani ve evcil çeşitlerin genomlarını sıraladı, bir araya getirdi ve karşılaştırdı. Tohum üretimi, çevresel adaptasyonlar, lif kalitesi ve hastalık direnci gibi bir dizi özellikle ilişkili genetik ve epigenetik farklılıkları keşfettiler. “Epigenetik”, genetik dizideki bir değişikliğin neden olmadığı, ancak genlerin ifade edilme şeklindeki değişikliklerin neden olduğu özelliklerdeki değişiklikleri ifade eder.
Çalışma, UT Austin’de bir bitki moleküler genetikçisi olan Z. Jeffrey Chen tarafından yönetildi. Araştırma ekibi ayrıca HudsonAlpha’dan Jane Grimwood ve Jeremy Schmutz’u da içeriyor.
NSF’nin Bütünleştirici Organizma Sistemleri Bölümü’nde program direktörü olan Kelly Dawe, “Bu çalışma, pamuğun poliploid genomlarını vahşi akrabalarıyla karşılaştırmanın uzun süredir aranan hedefine ulaşıyor” dedi. “Bu çalışmalar, dünyanın en ilginç ve önemli bitki ürünlerinden biri olan pamuk liflerini oluşturan genlerin evrimi ve işlevi hakkında önemli yeni bilgiler sağlıyor.”