Genetik ekibi daha iyi mısır bitkileri hedefliyor
26 farklı mısır genetik hattının yeni birleştirilmiş genomları, mahsulün zengin genetik çeşitliliğini gösteriyor ve çiftçiler tarafından değer verilen mahsul özelliklerini hangi genetik mekanizmaların açıkladığının daha iyi anlaşılması için zemin hazırlıyor.
bu ABD Ulusal Bilim Vakfı– Son zamanlarda dergide yayınlanan genomların finanse edilen haritalaması Bilimbir bitki genetikçisi olan Kelly Dawe tarafından yönetilen bir ekip çalışmasıydı. Gürcistan Üniversitesi.
NSF’nin Bütünleştirici Organizma Sistemleri Bölümü’nde program direktörü olan Gerald Schoenknecht, “26 farklı mısır genomunun karşılaştırmalı analizi, araştırmacılar ve yetiştiriciler için yıllarca önemli bir mısır genom kaynağı sağlıyor” dedi. Bu yeni genomları referans olarak kullanan bitki bilimcileri, daha iyi mahsul verimi veya stres toleransına yol açması muhtemel genleri daha iyi seçebilirler.
Dawe, “Modern genetik çağın çoğunda, tek bir genoma güvendik ve her şeyi onunla karşılaştırdık, ancak bir genomun tüm genlere sahip olmadığını öğrendik” dedi. “Bu, bir golf sopasına, bir lokma anahtara veya bir takım giysiye sahip olmak gibi bir şey. Biz, topluluk olarak, yaklaşımımızı yavaş yavaş birden fazla referans içerecek şekilde değiştirmeye çalışıyoruz. Amacımız, mısır genomunu tek bir büyük sıçramadan büyük bir sıçramaya dönüştürmekti. 26’ya referans.”
Dawe, proje üzerinde, makalenin ilk yazarı Matthew Hufford ve analizin yapıldığı Iowa Eyalet Üniversitesi’nden bir organizma biyoloğunun da dahil olduğu bir ekiple çalıştı.
Haritalanan ilk mısır genomu, Iowa Eyalet Üniversitesi’nde geliştirilen ve 2009’da tamamlanan B73 olarak bilinen genetik çizgiydi. O zamandan beri B73, mısır için birincil referans genomu olarak hizmet etti ve bir avuç ek genom düzeneği yalnızca Türkiye’de mevcut hale geldi. son birkaç yıl. Bu, bilim adamlarının, B73’te bulunmayan diğer mısır genomlarındaki genetik diziler hakkında sınırlı bir anlayışa sahip oldukları anlamına gelir.
Yeni çalışmada haritalanan 26 genom, çeşitli coğrafi bölgelerden ve çevre koşullarından patlamış mısırdan tatlı mısıra ve tarla mısırına kadar her şeyi kapsayan geniş bir genetik çeşitlilik yelpazesini kapsamaktadır.
Hufford, mısırda bulunan genetik çeşitliliğin, yeni genomların bir araya gelmesi için büyük engeller yarattığını söyledi. Mısır genomunun %85’inin yer değiştirebilen elementlerden veya genom boyunca tekrar eden modellerden oluştuğunu söyledi. Hufford, yer değiştirebilir öğeleri, parçaların çoğunun tek bir renk olduğu bir yapbozla karşılaştırdı. Tüm bu tekrarlar, parçaların nasıl bir araya geldiğini anlamayı zorlaştırıyor.
Hufford, “Yapboz parçasını nereye koyacağınızı söyleyen benzersiz bir renk veya şekil bulamazsanız, incinmiş bir dünyadasınız” dedi. “Ancak, benzersiz özelliklere sahip biraz daha büyük yapboz parçaları elde ederseniz, bu, süreci basitleştirir.”