Araştırmacılar koronavirüs istilasını ve enfeksiyonunu simüle ediyor, işbirlikçi konak hücreler buluyor

Kısmen bir ödülle desteklenen bilim adamlarından oluşan bir ekip ABD Ulusal Bilim Vakfıkullanılan süper bilgisayarlar Teksas Gelişmiş Bilgi İşlem Merkezi bir koronavirüs enfeksiyonunu simüle etmek – ve konakçı hücre reseptör proteinlerinde, enfeksiyona direnmek yerine enfeksiyona izin veren işbirlikçi davranış keşfetti. Bulgular, virüsü konakçı hücrelere kaynaştıran olası mekanizmayı ortaya koyuyor.

Kıdemli yazar Gregory Voth, “Spike proteininin iki ACE2 reseptörü ile çok işbirlikçi bir şekilde etkileşime girdiğini keşfettik” dedi. ders çalışma. “Bu, temel bir biyofiziksel içgörüdür.”

Ekip, kriyo-elektron tomografi verilerini kullanarak modeller oluşturdu ve verileri atomistik kaba taneli moleküler dinamiklerle birleştirdi. Voth, “İri taneli modeller, düz atomistik moleküler dinamik simülasyonlarından 1000 kata kadar daha hızlıdır, ancak temel fiziksel özellikleri korurlar.” Dedi.

Simülasyonlar, bir reseptör proteinine bağlı bir koronavirüs sivri ucunun diğer reseptör proteinleri tarafından ayrılarak virüsün insan konakçı akciğer hücreleriyle kaynaşmasına izin verdiğini gösterdi.

Voth, “Görünüşe göre delta ve omikron gibi değişkenler bu davranışı daha da fazla vurguluyor. Bu önemli bir adım. Gelecekteki antikorlar ve muhtemelen moleküler farmasötikler bu sürece müdahale edebilmelidir.”

Araştırmayı yayınladığından beri ekip, delta ve omikron gibi koronavirüs varyantlarının artan virülansını incelemek ve analiz etmek için modelleri revize etti.