Basmati pirinci sever misiniz? Bilim adamları şimdi genomunu sıraladılar
Yenilikçi bir genom dizileme teknolojisi kullanarak, Ulusal Bilim Vakfı-fonlanan araştırmacılar, kuraklığa dayanıklı ve bakteriyel hastalığa dirençli olan da dahil olmak üzere iki basmati pirinci çeşidinin tam genetik planını bir araya getirdiler. Bulgular, yayınlanan Genom Biyolojisiayrıca basmati pirincinin diğer iki pirinç grubunun melezi olduğunu gösteriyor.
Hintçe “kokulu” kelimesinden türetilen Basmati, güney Asya’da yetişen aromatik uzun taneli bir pirinç türüdür. Basmati ve ilgili aromatik pirinç çeşitlerinin ekonomik ve kültürel önemine rağmen, bunların evrimsel tarihi tam olarak anlaşılamamıştır.
Jae Young Choi, “Pirinç, dünyadaki en önemli temel ürünlerden biridir ve basmati grubundaki çeşitler, en ikonik ve değerli pirinç çeşitlerinden bazılarıdır” dedi. New York Üniversitesi ve çalışmanın baş yazarı. “Fakat yakın zamana kadar, basmati pirinci için yüksek kaliteli bir referans genom yoktu.”
Bir organizmanın tam DNA dizisini belirleyen tam genom dizilimi, bitkileri incelemek ve ürün çeşitlerini geliştirmek için önemli bir araçtır. Önceki araştırmalar, basmati pirinci için genomu, DNA’nın küçük parçalara bölündüğü ve daha sonra yeniden birleştirildiği kısa okuma dizilimi kullanarak bir araya getirdi, ancak verilerde eksik diziler ve boşluklar vardı.
NYU’nun Genomik ve Sistem Biyolojisi Merkezi’ndeki araştırmacılar, nanopore dizileme teknolojisini kullanarak basmati pirinci grubunun iki üyesinin genomunu sıraladılar.
Sıralama, basmati pirincinin diğer iki pirinç grubunun bir melezi olduğunu doğruladı. Basmati’deki genetik materyalin çoğu japonica’dan (Doğu Asya’da bulunan bir pirinç grubu), ardından pirinç grubu aus’tan (Bangladeş’te bulunur) gelir.
NSF’nin Bütünleştirici Organizma Sistemleri Bölümü program direktörü Gerald Schoenknecht, “Bu keşif, ortamlara ve kültürel tercihlere uyumun, genellikle tercih edilen aromatik bir pirinç çeşidi olan basmati pirincinin evcilleştirilmesini nasıl şekillendirmiş olabileceğine dair yeni bilgiler sunuyor” diyor.