NSF Haberler

Bir QR kodu kullanarak herbaria biyoçeşitliliğinin kilidini açma

Son on yılda, yeni nesil dizileme teknolojileri, genetik verilerin üretilme ve analiz edilme biçiminde devrim yarattı. Filogenetik alanında bu, araştırmacıların yaşamın soy ağacını hızla yeniden inşa ettikleri anlamına geliyordu; bu, Darwin’in 1837’de ilk soyoluşun taslağını çizmesinden bu yana biyologların üzerinde çalıştığı bir hedefti.

DNA’nın artık büyük miktarlarda dizilenebilmesindeki görece kolaylığa rağmen, bilim adamlarının öncelikle bu DNA’yı bir organizmadan, genellikle müzelerdeki ve herbaryumdaki çok sayıda örneğe veya bitki örnekleri koleksiyonlarına dayanarak çıkarması gerekir. Yalnızca bitkiler aleminde 250.000’den fazla türle, numune materyalinin elde edilmesi ve belgelenmesi, büyük araştırmalarda en çok zaman alan ve hataya açık süreçtir.

İçinde kağıt yayınlanan Bitki Bilimlerindeki Uygulamalar, ABD Ulusal Bilim Vakfı-fonlanan araştırmacılar, benzersiz nesne tanımlayıcıları, QR kodları ve vatandaş biliminin bir kombinasyonunu kullanarak toplama sürecini otomatikleştirdi.

Başyazar Ryan Folk, “Amacımız bilimsel topluluk için bir kaynak oluşturmaktı” dedi. Mississippi Eyalet Üniversitesi. “Gelecekte, bu tür tüm toplama bilgilerinin kolayca bulunabileceği ve çalışmanın tekrarlanmasına gerek kalmayacağı çevrimiçi ortamda bulunacağını umuyoruz.”

Her bir herbaryum belgesine benzersiz bir nesne tanımlayıcısı atanır ve fiziksel olarak iliştirilir ve numune, tanımlayıcı açıkça görülebilecek şekilde fotoğraflanır.

Numune bilgilerinin benzersiz nesne tanımlayıcıları ile bu şekilde dijitalleştirilmesi, araştırmacılar için değerli bir araç olacak ve nihayetinde dünyanın dört bir yanındaki müzelerde koleksiyonları dijitalleştirme çabalarını tamamlayacak. Ancak araştırmacılar bir sonraki adımı attı.

Veri toplamayı daha da kolaylaştırmak için her numuneye QR kodları atandı. Bu, laboratuvarda DNA’yı çıkarırken ve çoğaltırken, araştırmacıların artık numune verilerini elektronik tablolara manuel olarak girmek zorunda kalmadıkları anlamına geliyordu. Bunun yerine, biyologlar bir QR kodu taradığında bu bilgiler otomatik olarak dolduruldu.

NSF’nin Çevresel Biyoloji Bölümü’nde program direktörü olan Amanda Ingram, “Yüksek kaliteli sekans verilerinin oluşturulması ve analiz edilmesi, hayat ağacının yeniden yapılandırılmasında en büyük darboğazdı, ancak bu süreçler modernize edildiğinden, yeni tıkanma noktaları ortaya çıktı” diyor. . “QR kodlarının bu yaratıcı kullanımı, bilim adamlarının doğal tarih koleksiyonlarında saklanan bilgi hazinesinden içgörü elde etmek için daha fazla zaman harcamasına izin verme potansiyeline sahip.”

Bir yanıt yazın

E-posta adresiniz yayınlanmayacak. Gerekli alanlar * ile işaretlenmişlerdir