NSF Haberler

Covid-19 için tedavi seçeneklerini bulmaya yönelik bir makine öğrenimi yaklaşımı

2020’nin başlarında COVID-19 salgını patlak verdiğinde, doktorlar ve araştırmacılar etkili tedaviler bulmak için koşturdu. Ayrılacak çok az zaman vardı. Hesaplamalı bir biyolog olan Caroline Uhler, “Yeni ilaçlar yapmak sonsuza kadar sürer” diyor. Massachusetts Teknoloji Enstitüsü. “Gerçekten, tek uygun seçenek mevcut ilaçları yeniden kullanmaktır.”

Uhler’in ekibi, halihazırda piyasada bulunan ve potansiyel olarak özellikle yaşlılarda COVID-19 ile savaşmak için başka bir amaca dönüştürülebilecek ilaçları belirlemek için makine öğrenimine dayalı bir yaklaşım geliştirdi. Sistem, akciğer hücrelerinde hem hastalık hem de yaşlanmanın neden olduğu gen ekspresyonundaki değişiklikleri açıklar.

Bu kombinasyon, tıp uzmanlarının daha şiddetli semptomlar yaşama eğiliminde olan yaşlı hastalarda klinik testler için ilaçları daha hızlı aramasına olanak sağlayabilir. Araştırmacılar, RIPK1 proteinini COVID-19 ilaçları için umut verici bir hedef olarak belirlediler ve RIPK1’in ekspresyonu üzerinde etki gösteren onaylanmış üç ilaç belirlediler.

bulguları ABD Ulusal Bilim Vakfı– fonlanan araştırmalar dergide görünür Doğa İletişimi.

Araştırmacılar, en umut verici ilacı yeniden kullanma adaylarını üç geniş adımda sıfırladılar. İlk olarak, otomatik kodlayıcı adı verilen bir makine öğrenimi tekniği kullanarak olası ilaçların geniş bir listesini oluşturdular. Ardından, hem yaşlanmaya hem de SARS-CoV-2 enfeksiyonuna dahil olan gen ve protein ağını haritaladılar.

Son olarak, bu ağdaki nedenselliği anlamak için istatistiksel algoritmalar kullandılar ve ağ boyunca basamaklı etkilere neden olan “yukarı akış” genlerini belirlemelerine olanak sağladılar. Prensip olarak, bu yukarı yönlü genleri ve proteinleri hedef alan ilaçlar, klinik denemeler için umut verici adaylar olmalıdır.

NSF’nin Matematiksel Bilimler Bölümü’nde program direktörü olan Gabor Szekely, “Bu atılım, zaman içinde temel araştırmaları finanse etmenin bize günün sorunlarına yanıt vermek için ihtiyaç duyduğumuz bilgiyi nasıl verdiğinin bir örneğidir” diyor.

Bir yanıt yazın

E-posta adresiniz yayınlanmayacak. Gerekli alanlar * ile işaretlenmişlerdir