Hücrelerin planlarını analiz eden çalışma, okyanus mikroplarının küresel dağılımı ve çeşitliliğindeki yeni kalıpları ortaya koyuyor

Tek bir deniz suyu damlası, dünyanın dört bir yanından okyanus mikroplarının geniş bir temsilini içerebilir – küresel mikrobiyomun ekolojisi, evrimi ve biyoteknoloji potansiyeli hakkında yeni bilgiler ortaya çıkarır.

yeni NSF tarafından finanse edilen dergideki kağıt Hücre mikrobiyal türlerin çağdaş tanımlarına meydan okuyan ve metagenomik araştırmalardaki zorlukların arkasındaki nedenleri aydınlatan şaşırtıcı derecede biyolojik çeşitlilik bildirir. Araştırma, deniz mikroplarının iklim değişikliğine nasıl tepki verdiğini daha iyi anlayabilir.

Kıdemli araştırma bilimcisi Ramunas Stepanauskas, “Bu proje, küresel mikrobiyomdan büyük, rastgele bir genom örneğini okumak için ‘büyük veri’ yaklaşımını kullanıyor ve daha sonra birçok soruyu yanıtlamak için araştırıyoruz” dedi. Okyanus Bilimleri için Bigelow Laboratuvarı Maine’de ve makalenin kıdemli yazarı. “Sonuçlarımız, okyanustaki mikrobiyal çeşitlilik hakkında daha derin bir anlayış, enerji kaynakları ve biyosentetik yetenekler hakkında yeni bilgiler ve tüm ortamlardaki mikropların incelenmesi için yeni araçlar sağlıyor.”

Araştırmacılar, Global Ocean Reference Genomes Tropics veri tabanını oluşturmak için 12.000’den fazla bireysel mikrobiyal genomu analiz ettiler. Analiz ettikleri her hücrenin genetik olarak benzersiz olması onları şaşırttı. Aslında, çok azı aynı tür olarak kabul edilecek kadar benzerdi.

Mikrobiyal çeşitliliğe ilişkin bu yeni bakış açısı, hem yerel hem de küresel ölçekleri içermektedir. Ekip, küresel dağılım modellerini öğrenmek için tropik ve subtropik bölgelerden (dünya okyanuslarının üçte ikisi) toplanan örnekleri analiz etmek için Bigelow Laboratuvarı’nın Tek Hücreli Genomik Merkezi’ndeki en son teknolojileri kullandı. Ayrıca Sargasso Denizi’nden tek bir çay kaşığı suda 6.000’den fazla bireysel hücrenin planlarını okuyarak yerel mikrobiyal çeşitliliği de incelediler.