Makine öğrenimi, SARS-CoV-2’yi yayma potansiyeline sahip memeli türlerini tanımlar
COVID-19’a neden olan virüs SARS-CoV-2’nin insanlar ve diğer memeliler arasında ileri geri bulaşması, yeni varyant riskini artırır ve hastalığı kontrol etme çabalarını tehdit eder.
A ABD Ulusal Bilim Vakfı tarafından finanse edilen araştırma, yayınlananRoyal Society B Tutanakları, 5.400 memeli türünün virüsü yayma kapasitesini tahmin etmek için yeni bir modelleme yaklaşımı kullandı ve tahmin kapasitesini bir büyüklük sırasına göre genişletti. İşaretlenen yüksek riskli türlerin birçoğu insanların yakınında ve COVID-19 sıcak noktalarında yaşıyor.
Yüksek riskli memeli türlerini tahmin etmede önemli bir darboğaz, hayvanlarda SARS-CoV-2’nin bağlandığı hücre reseptörü olan ACE2 hakkındaki sınırlı verilerdir. ACE2, SARS-CoV-2’nin konakçı hücrelere girmesine izin verir ve tüm büyük omurgalı gruplarında bulunur. Tüm omurgalıların ACE2 reseptörlerine sahip olması muhtemeldir, ancak diziler yalnızca 326 tür için mevcuttu.
Bu engelin üstesinden gelmek için ekip, 5.400 memeli türünün biyolojik özelliklerine ilişkin verileri mevcut ACE2 verileriyle birleştiren bir makine öğrenimi modeli geliştirdi. Amaç: yüksek zoonotik kapasiteye sahip — SARS-CoV-2 ile enfekte olma ve onu diğer hayvanlara ve insanlara bulaştırma yeteneği olan memeli türlerini belirlemek. Araştırmacıların geliştirdiği yöntem, COVID-19’un ötesindeki hastalıklar için tahmin kapasitesini genişletmeye yardımcı olabilir.
Bir virüsün insanlardan hayvanlara geçip tekrar insanlara geçmesine ikincil yayılma denir. Bu fenomen, insanlarda daha öldürücü ve aşılara daha az yanıt veren yeni varyantların oluşumunu hızlandırabilir. SARS-CoV-2’nin ikincil yayılımı, en az bir yeni SARS-CoV-2 varyantına yol açtığı Danimarka ve Hollanda’da çiftlik vizonları arasında zaten rapor edilmiştir.
Kıdemli yazar ve Cary Enstitüsü hastalık ekolojisti Barbara Han, “ikincil yayılma, yeni konakçılarda kurulan SARS-CoV-2’nin insanlara potansiyel olarak daha fazla bulaşıcı suşları iletmesine izin verir. SARS-CoV-2’yi bulaştırmada etkili olan memeli türlerinin belirlenmesi, sürveyansa rehberlik etmede ve önlemede önemli bir adımdır.” Virüsün sürekli olarak insanlar ve diğer hayvanlar arasında dolaşarak hastalık kontrolünü daha da maliyetli ve zor hale getirmesi.”