Silk Road, elmaları geliştirmek için genomik kaynaklar içerir
MÖ 2. yüzyıldan 14. yüzyıla kadar ticaretin geliştiği Çin ile Batı Avrupa arasındaki 4.000 millik uzanan efsanevi İpek Yolu, en sevdiğimiz ve en değerli meyvelerimizden biridir: evcilleştirilmiş elma (ev eşyası).
Atıştırmalık paketleyen gezginler, elmaları bir noktadan toplar, yer ve çekirdeklerini kilometrelerce uzağa fırlatırdı. Tohumlar yeni yerlerinde büyüdü, yabani türlerle melezlendi ve bugün var olan 7.000’den fazla elma çeşidini yarattı.
Yabani türlerle melezlemeler, elma genomunu çok karmaşık ve çalışılması zor hale getirdi. Bir bilim adamı olan Zhangium Fei tarafından yönetilen çok disiplinli araştırmacılardan oluşan küresel bir ekip Boyce Thompson Enstitüsü — evcilleştirilmiş elma ve onun iki ana vahşi ataları için eksiksiz kromozom setlerini bir araya getirmek için en son sıralama teknolojilerini ve biyoinformatik algoritmaları uygulayarak bu sorunu ele aldı.
Kısmen finanse edilen araştırmacılar, ABD Ulusal Bilim Vakfıelmanın benzersiz evcilleştirme tarihinin, boyut, tat, tatlılık ve dokuda iyileştirmeler için kullanılabilecek keşfedilmemiş gen kaynaklarına yol açtığını keşfetti.
Fei, “Bitki yetiştiricileri, tüketiciler için en önemli olan ve bugün esasen lezzet olan özellikleri geliştirmek için bu ayrıntılı bilgileri kullanabilir” diyor.
“Belki daha da önemlisi,” diye ekliyor, “bilgi, yetiştiricilerin strese ve hastalığa karşı daha dirençli elmalar üretmesine yardımcı olacaktır.”
Araştırma bir şekilde anlatılıyor kağıt yayınlanan Doğa GenetiğiBTI, Cornell Üniversitesi, Cornell AgriTech, ABD Tarım Bakanlığı ve Shandong Tarım Bilimleri Akademisi’nden yazarlarla.
Mevcut çalışmada, araştırmacılar üç türün tam referans genomlarını sıraladı, bir araya getirdi ve karşılaştırdı: Gala, Avrupa yengeç ve Orta Asya yaban elması. Son iki tür, elmanın iki ana vahşi atasıdır ve birlikte evcilleştirilmiş elmanın genomunun yaklaşık %90’ını oluşturur.
Sonuçlar, elma yetiştiricilerine daha iyi bir elma yapmalarına yardımcı olabilecek ayrıntılı genomik yol haritaları sağlıyor.
Diane Okamuro, “Bu, DNA dizileme teknolojilerindeki ve karşılaştırmalı genom bilimindeki ilerlemelerin vahşi türlerde saklı muazzam genetik potansiyeli nasıl ortaya çıkardığının ve yetiştiricilerin bu kaynakları ekonomik açıdan önemli ve besleyici bir ürün geliştirmek için nasıl kullandıklarının mükemmel bir örneğidir” diyor. NSF’nin Bütünleştirici Organizma Sistemleri Bölümü’nde program direktörü.