500 milyon yıllık evrimin üzerindeki eklembacaklı genomik çeşitliliğinin çözülmesi
Bilim adamları tarafından karşılaştırmalı analizler İsviçre Biyoinformatik Enstitüsü ve 500 milyon yıllık evrimi kapsayan 76 eklembacaklı türünün diğer kurumları, bu türlerin başarısının ardındaki temel faktörlere işaret eden genomik değişiklikleri ortaya koyuyor.
Uluslararası ekip, dergide i5k adlı bir pilot projenin sonuçlarını bildirdi. Genom Biyolojisibinlerce eklembacaklının küresel sıralama girişimini başlatıyor.
Eklembacaklılar, tüm büyük ekosistemlerden yararlanmalarına izin veren çok sayıda uyarlamayla, Dünya üzerindeki tür açısından en zengin ve çeşitli hayvan grubunu oluşturur. Gezegenimizin sağlıklı ekolojisinde hayati roller oynuyorlar ve tozlaşma ve biyolojik atık geri dönüşümü veya mahsulleri yok etme ve hastalık yayma yoluyla insanlığın başarısı için hem yararlı hem de zararlılar.
Kısmen finanse edilen ekibin analizleri Ulusal Bilim Vakfı, gen içeriği ve gen yapısındaki değişiklikleri tahmin etmek için gen evrim geçmişlerini izlemeye odaklandı. Bu, ana eklembacaklı alt gruplarının her biri arasında ve içinde, boyutları önemli ölçüde artan veya azalan, yeni ortaya çıkan veya kaybolan veya protein alanlarını yeniden düzenleyen gen ailelerinin tanımlanmasını sağladı.
Sindirim, kimyasal savunma ve eklembacaklı dış iskeletlerinin önemli bir bileşeni olan kitinin inşası ve yeniden modellenmesi ile bağlantılı işlevlerde yer alan proteinleri en dinamik şekilde değiştiren kodlayan gen aileleri bulundu.
Bilim adamları, sindirim süreçlerinin ve zararlı kimyasalları nötralize etme mekanizmalarının uyarlanabilirliğinin, eklembacaklılara çeşitli ekolojik nişleri fethettikleri kadar iyi hizmet etmiş olabileceğini söylüyor. Bölümlere ayrılmış bir vücut planı ve dinamik bir dış iskelet ile gelen esneklik, eklembacaklıların gelişmesini sağladı.
NSF’nin Biyolojik Altyapı Bölümü’nde program direktörü olan Peter McCartney, “Genom evrimi çalışmaları, zamanın derinliği, tür sayısı ve ele aldıkları işlevsel ilişkiler açısından ölçeklendirme anlayışımızı geliştiriyor” diyor. “Bölüm, ekiplerin tek bir laboratuvarda gerçekleştirmesi zor olan bunun gibi analizler yapmasına izin veren paylaşılan hesaplama kaynaklarını destekliyor.”