Mikroplar vücudumuzda iş başında ve araştırmacılar onların neyin peşinde olduklarını anladılar.

Metin mesajlarını ve e-postaları otomatik olarak tamamlamaya çalışan sinir bozucu derecede yardımcı olana benzer bir algoritma artık daha iyi bir amaç için kullanılıyor. NSF tarafından finanse edilen araştırmacıları Drexel Üniversitesi ciltler dolusu genetik kodu inceleyerek insan vücudundaki mikrobiyal toplulukları tanımlamak için örüntü tanıma yeteneğini kullanıyor. Yöntemleri, Crohn hastalığı gibi mikrobiyota bağlantılı rahatsızlıklar için tıbbi tedavilerin gelişimini hızlandırabilir.

Son on yılda bilim adamları, insan vücudunda doğal olarak bir arada bulunan bakteri ve virüs gruplarının sindirim, metabolizma ve hastalıklarla mücadele gibi bazı hayati işlevlerde önemli rol oynadığını anlama konusunda muazzam ilerleme kaydettiler. Ancak bunu nasıl yaptıklarını anlamak bir soru olarak kalıyor.

Bilim adamları, yüksek verimli genetik dizileme ve doğal dil işleme bilgisayar algoritmalarının akıllı bir kombinasyonu yoluyla bu soruyu yanıtlamaya yardımcı olmayı umuyorlar. Dergide yayınlanan sonuçları PLOS BİRinsan mikrobiyal topluluklarını tanımlayabilen ve nasıl çalıştıklarını ortaya çıkarabilen, RNA’da bulunan kodları analiz etmenin yeni bir yöntemini rapor edin.

İnsan mikrobiyal ortamı – veya mikrobiyom – üzerine yapılan araştırmaların çoğu, tüm farklı mikrop türlerinin tanımlanmasına odaklanmıştır. Ve mikrobiyotaya bağlı rahatsızlıklar için yeni ortaya çıkan tedaviler, mikrobiyomdaki dengesizliklerin veya sapmaların hazımsızlık veya Crohn hastalığı gibi sağlık sorunlarının kaynağı olduğu fikri altında çalışır.

Ancak bu dengesizlikleri düzgün bir şekilde düzeltmek için, bilim adamlarının hem etkilenen bölgelerde hem de tüm vücutta var olan mikrobiyal topluluklar hakkında daha geniş bir anlayışa sahip olmaları önemlidir.

Drexel’de Büyük Veriden Biyolojik Çeşitlilik Merkezi, araştırmacılar, büyük miktarda genetik dizilimin deşifre edilmesine yardımcı olmak için algoritmalar ve makine öğrenimi uyguluyorlar. Çalışma, mikrobiyoloji ve genetik araştırmalarını ıslak laboratuvardan veri merkezine taşıdı ve organizma etkileşimlerini ve evrimi incelemek için metagenomik adı verilen hesaplamalı bir yaklaşım yarattı.